阿里云基因分析平台是什么？基因分析平台详细介绍

阿里云基因分析平台是什么？阿里云百科aliyunbaike.com阿里云基因分析平台是用户友好的基因分析一站式平台，提供以支持工业界、学术界生物信息分析为核心能力的服务。平台提供支持高准确率、低成本、高性能、弹性计算任意规模基因数据的方案，帮助用户安全、敏捷和高效地处理基因分析任务。平台支持GA4GH社区开放标准，并集成了丰富的算法、应用、流程工具和公共数据集。

基因分析平台功能

阿里云基因分析平台支持基因计算分析、任务流程化、数据传输管理和数据应用开放：

基因计算分析

平台集成了生信分析软件，包含序列比对、排序去重、变异识别、群体分析等多种应用。平台提供了基于CPU/GPU/FPGA的加速算法和应用，减少数据分析时间，降低成本。同时支持第三方分析软件和镜像。

任务流程化

无需创建和管理任何集群，使用模块化、版本化和开箱即用的生信流程和工具，直接分析任意规模的基因数据，作业自动执行，提供实时运行日志和性能监控。支持高弹性批量投递任务，实现秒级资源扩容，计算资源细颗粒度申请，运行结束即停止计费。

数据传输管理

借助阿里云各地的数据中心网络，安全快速的在线传输数据。数据完全存储在用户的对象存储OSS中，自定义数据结构，管理组织基因数据，方便浏览和检索。

数据应用开放

统一中心化的应用仓库和公共数据集服务，平台用户可以获取权威、验证过的应用。平台内容对外开放，方便下游生态聚合。

基因分析平台优势

高性能算法

平台支持多种基因分析算法的优化，使用基于CPU/GPU的算法加速GATK最佳实践等分析流程，具有快速和准确的特点，可以减少数据分析时间，降低成本，可领代金券 aliyun.club 免费领取阿里云上云补贴代金券。

计算费用优化

CPU/MEM细粒度计费，支持按需自定义CPU、内存、存储规格和大规模弹性调度，文件访问I/O效率优化，大幅度降低NGS数据分析费用

规模灵活弹性

从0起始到千万样本，容量灵活，适用于任意规模的用户。无需提前规划，完全按业务弹性扩展，并行处理所有计算作业，且只需为使用
资源付费

定制化技术服务

按需提供WDL定制化服务，帮助解决生物信息程序在云平台上的运行问题，提供具体到算法级的问题解决能力

精细的管理

完全Serverless，免运维的基因分析平台，从CAPEX转向OPEX投入，样本级计费，成本清晰可预测。大批量计算作业自动运行和监控，精细可靠

应用社区标准

支持社区标准的流程描述语言（WDL），应用无需迁移改造，即可在平台中运行。具有版本化、模块化、可迁移的开发和使用优势，线上线下统一

开放的生态

标准的流程执行引擎，提供OpenAPI和SDK，为下游系统开发提供计算底座。开放公共数据集，生信工具镜像和第三方软件，丰富数据和应用生态

安全可靠合规

数据完全存储在用户的对象存储OSS中，平台提供严格的访问控制和细粒度的权限管理，操作日志记录，满足审计需求

基因分析平台使用场景

阿里云基因分析平台可用于基因数据分析、测序生产自动化和基因云平台开发等使用场景：

基因数据分析

为任意规模的用户，提供开箱即用的基因分析服务，效率高，成本低，灵活可靠，最快30分钟即可获取海量数据的计算结果。

• 提供常用的生信流程和最佳参数配置，直接读写对象存储OSS数据，使用简单方便。
• 使用GPU/FPGA等多种加速工具，结合阿里云海量计算资源和调度优化，大大降低成本，提高效率。
• 模块化的工具和流程，版本化管理，用户可以创建或者编辑自己的生信流程，适配不同类型数据分析要求。

测序生产自动化

测序仪下机数据，自动上传到平台，满足条件后自动触发质控和数据分析，可高效完成用户实验室大批量样本标准化生产交付任务。

• 对接任意测序平台和下机数据类型，可批量或流式上传原始数据。
• 配置自动化分析流程，支持批量样本同时分析，完成后推送通知。
• 原始数据和分析结果可以通过OSS直接在线交付，或者进行归档备份。

基因云平台开发

集成阿里云基因分析平台引擎，利用社区丰富的开发资源，快速开发满足自身业务需要，高性能可扩展的企业云平台。

• 提供OpenAPI/SDK，开发者可以集成平台任意功能和现有的工具软件数据集。
• 采用WDL社区标准，避免平台锁定，并可以充分利用开源社区成熟的开发套件。
• 基因分析平台强大的计算引擎可以保证企业云平台安全可靠，稳定高性能，满足大规模生产和应用要求。

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